Dice que está utilizando WordPress 6.4 y que los problemas surgieron después de la última actualización principal. Sin embargo, la última actualización principal es la 6.7. ¿Qué versión de WordPress estás usando actualmente? Recomendaría 6.7 de todos modos ya que muchas cosas han cambiado en el editor de bloques desde 6.4.
Desafortunadamente, sin conocer la programación no es posible juzgar hasta qué punto su programación individual puede no ser compatible con ella. ¿Puedes ponerlo a disposición de alguna manera, por ejemplo, a través de github o gists?
El problema podría estar relacionado con cómo se registran sus metacampos para el editor de bloques. Comprueba que estás usando register_post_meta() con el adecuado show_in_rest argumento establecido en true. Esto garantiza la compatibilidad con el editor de bloques.